Hola,
Utilizar arrays anidados en el método replaceListVariable se permite desde el lanzamiento de phpdocx 12 (https://www.phpdocx.com/news/post/phpdocx-v12-release-notes/223):
- replaceListVariable allows using sub-arrays.
 
por ejemplo:
$items = array(
  'First item',
  'Second item',
  array(
    'Subitem A',
    'Subitem B',
    'Subitem C',
    array('Subitem C.1', 'Subitem C.2'),
    'Subitem D'
  ),
 'Third item'
);
$docx->replaceListVariable('LISTVAR', $items);Versiones anteriores de phpdocx no lo permiten. Te recomendamos actualizar tu licencia a la última versión disponible.
Saludos.